Zoho インボイスは、見積書や請求書の作成、繰り返し請求の自動作成や、入金管理、未入金請求への督促自動メールなど、見積り請求業務に特化したシンプルで使いやすい操作性のサービスを提供しています。
Zoho CRM　は、商談管理や連絡先管理、メール配信機能などをメインで提供し、見積書や請求書の発行も可能ですが、
入金管理や繰り返し請求といった機能は提供していません。
Zohoインボイスに比べるとZoho CRMは複雑なシステム設計・運用が可能で、機能的にはZoho インボイスの大部分を網羅していますが、 見積り請求業務に関しては操作が煩雑となります。
また、Zoho インボイスは、プロフェッショナルプランであれば利用ユーザー数が無制限となりますので、請求業務だけであればインボイスの方が価格的なメリットがあります。

http://www.zoho.jp/invoice/service/customers.html#2
http://www.zoho.jp/invoice/help/customers/invoice-customers.html#import-customers-and-contacts

Zoho インボイスに取り込まれた顧客向けに、Zoho インボイスで請求書を発行した場合、連携して連絡先や取引先の関連情報として表示することができます。

Zoho CRM [設定]-->[Apps&オプション]の、Zohoサービス連携にてZoho Invoiceとの連携をセットアップ。


↓
連携すると、連絡先や取引先の詳細画面にて、Invoiceの発行データが表示されるようになります。

Zoho CRMの無料プランはメール配信機能が利用できないなど、いくつかの制限がありますが、将来的に必要になったら、有料プランへのアップグレードをご検討いただくのがよろしいかと思います。

Zoho CRMの各プランの料金と機能比較の詳細は以下をご参照ください。

今後ともZohoサービスを宜しくお願い申しあげます。

ゾーホージャパン　中沢